passwd とか group 等のユーザ情報を Vine 4 から引き継いでいるため，uid と gid のデフォルト値が Vine 5.2 や 6 とそぐわず，デフォルトの apache2 上で CGI 動作時にエラーが出てしまいます．
ログをみるとこんな感じ．
/var/log/apache2/error.log
[Sun Dec 11 23:04:38 2011] [error] [client xxx.yyy.zzz.www] suexec policy violation: see suexec log for more details, referer: http://xxxxxxxx/
[Sun Dec 11 23:04:38 2011] [error] [client xxx.yyy.zzz.www] Premature end of script headers: XXXX.cgi, referer: http://xxxxxxx/
/var/log/apache2/suexec.log
[2011-12-11 23:02:16]: cannot run as forbidden gid (100/XXXX.cgi)
[2011-12-11 23:02:17]: uid: (500/username) gid: (100/users) cmd: XXXX.cgi
これは，suexec のデフォルト指定では gid >= 500 から CGI 実行を許すのに対して，実際の gid が 100 と小さいことが原因のようです．
というわけで，apache2 を rebuild して，suexec の制限を緩めます．
# apt-get update
# apt-get source apache2 # apache2 の source rpm を取得．
# rpm -Uvh apache2-2.2.14-16vl5.src.rpm # 取得した source rpm を rpmbuild のディレクトリに展開．
SPEC ディレクトリの spec ファイルを編集
ここを書き換えます．
修正前
--with-suexec-uidmin=500 --with-suexec-gidmin=500 \
修正後
--with-suexec-uidmin=100 --with-suexec-gidmin=100 \
uid は書き換えなくてもOKです．
# rpmbuild -ba --target x86_64 apache2-vl.spec # rebuild． target architecture が 386系なら i686 とかしてください．
# rpm -Uvh apache2-*2.2.14-16vl5*.rpm # インストール．すでに入っている apache2 とリプレイスなら，--replacepkgs オプションが必要です．
とりあえず動作するようになったけれど， apache2 更新のたびに rebuild はめんどいね．
